Em 1941, aos 17 anos, Seel foi deportado com cerca de 200 homens para a Alemanha, pelo facto de ser homossexual. Lá, ele foi torturado por guardas da SS e enviado para o campo de concentração Schirmeck-Vorbruck, na Alsácia. Enquanto esteve preso, foi obrigado a presenciar o assassinato de seu namorado, Jo, na época com 18 anos. Jo teve seu corpo dilacerado por cães.
Depois de seis meses, Seel foi solto e retornou a França. A sua experiência está relatada no livro "Eu, Pierre Seel, Homossexual Deportado: Uma Memória do Terror Nazi", lançado em 1994. A obra foi traduzida para o inglês e o espanhol e serviu de referência para o documentário "Parágrafo 175".
Historiadores estimam que entre 5 e 15 mil homossexuais foram presos em campos de concentração pelos nazis.